下设第一医学中心（原内科、外科临床部，医技部、门诊部）、第二医学中心（原南楼临床部）、第三医学中心（原武警总医院）、第四医学中心（原304临床部）、第五医学中心（原302、307医院）、第六医学中心（原海军总医院）、第七医学中心（原陆军总医院）、第八医学中心（原总参总医院）、海南医院等单位。

第一医学中心：由原解放军总医院的内科、外科临床部、医技部和门诊部组建。在消化内镜治疗、机器人微创技术、5G远程手术、慢性肾病治疗等方面具有领先优势。

第二医学中心：原为解放军总医院南楼临床部。在老年多器官功能衰竭系列研究、老年慢性阻塞性肺疾病呼吸衰竭的机械通气、高龄患者心血管急危重症诊疗等方面具有领先优势。

第三医学中心：原为武警总医院，前身是1937年4月创建于延安的中央军委警卫营卫生所，在灾害救援医学、眼眶病、眩晕病诊疗等方面具有领先优势，担任国际医疗救援任务。

第四医学中心：原为解放军总医院第304临床部，前身是1945年11月诞生于东北的第二十九后方医院，是全军战创伤外科救治中心，以创（烧）伤、急救和危重症救治三大方向为主要特色。

第五医学中心：由原解放军第三0二医院、第三0七医院合并组建，前身分别为1939年11月组建的延安中央医院和1957年8月创建的国家卫生部同位素医院，在病原体感染导致的传染病和继发病、疑难重症肝病、血液病、肿瘤诊治等方面具有领先优势。

第六医学中心：原为海军总医院，前身是海军北京医院，在海战伤救治、援潜救生、高压氧治疗、结节病和视光学疾病诊治等方面具有领先优势。

第七医学中心：原为陆军总医院，前身为1912年在天津创建的国民政府陆军军医学校附属医院，在外科诊治、微创治疗、新生儿救治等方面具有特色优势。

第八医学中心：原为解放军第三O九医院，前身为1933年10月创建的红四方面军第三分院，在结核病防治、器官移植、呼吸危重症救治等方面具有特色优势。

海南医院：原为解放军总医院分院，在海战伤救治、皮肤病诊疗、5G远程门诊等方面具有特色优势。

1）微信预约：医保患者需来院缴费取号后到分诊台刷卡候诊；非医保患者无需取号，直接到分诊台刷卡候诊。

2）114预约：电话及网络预约为北京市统一预约挂号平台预约:可预约七日内号源，支持24小时服务，每天上午7:00开始放号，下午3:00停止次日预约挂号。预约成功后请根据手机短信提示的时间和地点取号，过时号源作废。自助机和窗口均可办理取号（自助机可办理就医卡及充值、缴费业务）。

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3）自助机预约：须持银联卡（信用卡、储蓄卡均可），医保卡（医保患者）

一般就诊流程为：取号-就诊-缴费-取药-离院

有关体系内、体系外、军队移交地方军人，医保、地方公疗患者、异地医保就医等相关就诊流程，请点击下面链接，见总医院官网相关规定。

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